Madrid está súper bien comunicado por el Metro, si tienes una parada cerca estás en el centro en un tiempo razonable.
Yo me alojaría en la periferia y me movería en Metro, yo vivo a las afueras y tengo el metro a 3 minutos de mi casa y voy al centro con mucha frecuencia con mi hijo, al Prado, al Reina Sofía (voy mañana con el cole, por cierto), al Teatro y al Palacio Real, a la Plaza Mayor, al Retiro,...
Creo que es más barato, menos ruidoso... Y el horario del Metro es muy amplio. Pensad que de una parada a otra hay si acaso 2-3 minutos, incluso de unas a otras puedes ir andando, como de Sol a Callao, o de Sol a Ópera... Yo le veo muchas ventajas a alojarse en las afueras.
Edito y os dejo este hotel que acabo de ver: No puedes ver este link.
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